进水经过布水器输入反应器，与下降管循环来的污泥和出水均匀混合后，进入一个反应分离区内，流化床反应室。在那里，大部分COD被降解为沼气，在这个分离区产生的沼气由低位三相分离器收集和分离，并产生气体提升。气体被提升的同时，带动水和污泥作向上运动，经过一“上升”管达到位于反应器顶部的气体/液体分离器，在这里沼气从水和污泥中分离，离开整个反应器。水和污泥混合经过同心的“下降”管直接滑落到反应器底部形成内部循环流。从一分离区的出水在二阶段低负荷后处理区内被深度处理，在那里剩余的可生物降解的COD被去除，在上层分离区产生的沼气被顶部的三相分离器收集，并沿二“上升管”，输送到顶部旋流式气体/液体分离器，实现沼气分离和收集。同时，厌氧出水经过出水堰离开反应器自流进入后续处理中。

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